Một tiếng ầm vang lên, trong tức khắc, mặt trăng mất 70% diện tích. Và thủ phạm của việc này không ai khác là thứ siêu sinh vật - kẻ tội đồ được cho là sẽ phá hủy trái đất vào tháng 3 năm sau. Nhưng vì một lí do nào đó mà hắn lại chọn trở thành giáo viên tại đây, trong chính lớp học ở trường cấp 2. Ám sát con quái vật vượt quá tầm hiểu biết của con người này là cách duy nhất để cứu lấy trái đất, nhưng việc đến cả các nhà lãnh đạo trên thế giới với quân đội hùng mạnh còn bó tay lại được giao cho các học sinh của lớp đó…lớp E của trường cấp 2 Kunugigaoka. Gã giáo viên lạ mặt xuất hiện khi học kì 1 bắt đầu. Nhờ giáo viên này mà những học sinh của lớp E - hay lớp End - Lớp học của sự kết thúc, thông qua lớp học ám sát - một lớp học đặc biệt, đã trải qua nhiều thứ thách khác nhau, kết giao được với những người bạn mới và dần tự tin vào bản thân hơn. Liệu các học sinh có thể hoàn thành nhiệm vụ ám sát giáo viên chủ nhiệm - Koro-sensei được không đây?!